指纹识别率有待提高，主要表现为部分人无法使用指纹锁，通常有1%5%的人无法使用指纹锁，或者需要多次识别才能通过。不过也有厂家在开始做指静脉锁来弥补指纹识别的这项缺点。如果指纹锁能做到98%以上的人都能方便使用，那就是相当不错的了。任何产品都有其本身的缺陷，绝大多数人能使用，就可以了。
电池寿命长短不一。高耗能功能的多少、电路设计的科学性、漏电保护的合理性、使用人数和频率的高低都是影响供电的重要因素。厂家通常标明指纹锁的电池寿命可以达到一年，在实际应用中，好多厂家的指纹锁寿命都不到半年，而且指纹锁没有提示用户更换电池，往往造成把用户拒之门外，造成不必要的麻烦。特别是增加邑或IC卡功能后，耗电会非常大。装办公室和装家里使用也完全是两个概念。
